永续合约的交易成本通常由两部分组成：开仓、平仓时产生的交易手续费，以及持仓跨过结算时点后产生的资金费用。前者由交易所按照订单名义价值收取，后者则是多空持仓者之间的定期资金交换。杠杆并不会直接降低同等仓位的手续费，真正决定成本的核心，是仓位规模、成交价格、挂单或吃单身份，以及账户对应的费率等级。
永续合约手续费计算并不以保证金为直接基数，而是看名义价值。以U本位合约为例，名义价值大致等于合约数量乘以成交价格，交易手续费则是名义价值×手续费率。假设交易者开仓1个BTC的BTCUSDT永续，成交价为60000 USDT，名义价值就是60000 USDT。按照0.05%的吃单费率计算，开仓手续费为30 USDT；之后以60000 USDT平仓，平仓手续费仍约为30 USDT，来回交易成本合计60 USDT。实际费率会随平台、VIP等级、合约品种和活动政策变化，页面显示的个人费率才是最终标准。
挂单和吃单是影响手续费的重要细节。市价单通常会立即成交，属于吃单，费率往往高于挂单；限价单只有留在订单簿中、等待市场主动成交时，才通常算作挂单。很多交易者容易忽略的一点是，限价单不等于一定享受Maker费率，若下单价格直接穿过盘口并立即成交，同样可能被认定为Taker。开仓时收一次，平仓时再收一次，分批建仓、分批止盈也会按每次实际成交分别计算，成交价格变化还会让平仓手续费随之变化。
资金费用常被口头称作资金费率手续费，但它和平台收取的交易手续费并不是一回事。资金费率为正时，多头向空头支付；资金费率为负时，空头向多头支付，交易所通常只是撮合这笔资金交换。计算方式一般是持仓名义价值乘以当期资金费率。仍以60000 USDT仓位为例，资金费率为0.01%时，一次结算对应6 USDT。常见结算周期是8小时，部分交易对可能调整为1小时、2小时或4小时，只有结算时刻仍持有仓位，才会产生支付或收取。
